Верхняя давит в жёлтую трубку и хочет вытечь. Нижняя часть пассивная и никак не участвует в вытекании.
Когда конец синей трубки ниже жёлтой трубки - то это аналогично закрытой бутылке с целой крышкой и без синей трубки. Верхняя часть воды не может вытекать, т. к. не может как бы оторваться от воздушного кармана. Пузырьки воздуха через жёлтую трубку не поступают, т. к. она немного под углом вверх.
Когда конец синей трубки поднимается выше жёлтой, то верхняя часть воды как бы высасывает воздух по синей трубе и под собственным весом вытекает.